医生高静与未婚夫国栋前往日本屿那国岛海底的神秘古城举行浪漫的订婚仪式，怎知海底发生意外，高静失去知觉后获救，国栋死亡。

　　国栋真的死了吗？

　　谁是凶手？

　　痛不欲生的思念引导着高静寻找爱的下落。在一系列惊险离奇的冒险后，埋藏在深海古城的秘密浮出水面……

　　举世惊艳的与那国岛海底古城

　　影片中的故事是发生在日本与那国的一座真实存在的、沉睡海底万年的古城之中。一九八六年，一名潜水员潜进了日本最西端的与那国岛海域里，在深海的海床上，意外地发现了用巨石建造的都市遗迹，震惊世界的海底文明正式曝光。其后人们不断在Iseki Point的海域里，发现无数教人匪夷所思的石质建材，包括巨型石块、石柱、大型阶梯建筑、经过打磨的梯级、运河、洞穴和雕刻等文明产物。最后专家推断这大片珍贵遗迹，是大约一万年前陆沉的先进都市。从此，一个本来藉藉无名的日本外岛，距离台湾仅一百十一公里的僻偏小岛，聚焦了全球目光，成为考古学上另一个光芒四射的魅力焦点。

　　徐克在拍摄《深海寻人》时决定以全程实景拍摄的手法，将这个充满挑战性的海底都市作故事背景，拍摄一部集合悬疑、惊悚、浪漫于一身的电影。大部分日本人都不知道，这是首家电影公司，愿意花费巨资、人力和时间，认真制作一部以与那国岛遗迹为题材的电影作品。

　　因为这个庞大的海底建筑遗迹，有着很多与众不同的特征。首先，那些经过加工的石块都非常巨大，而且排列得很集中。这些石巨形成一幢巨大阶梯型建筑，外型有点像金字塔，最大的石块长二百五十米，高二十五米；斜坡一般的外墙，加上大角度的脚踏，令人推测那是一个供人膜拜的场所。另外，在大堆石雕之中，屹立着一块形势独特的巨石，该石约七米高，外型彷佛像一张男性面孔，上面并刻上很多眼睛。附近的海床上，还发现一块刻有巨龟的巨石。有人相信，这巨龟石就是日本家传户晓的神话，蒲岛太郎故事里的巨龟。在那个寓言中，心性善良的年轻渔夫拯救了大海龟，获邀畅游奇异魔幻的海底王国。不管如何，这些遗迹不但开拓了人类文明研究的新领域，丰富了传统寓言的内涵，今天更为电影工作者带来全新的创作空间。在《深海寻人》中，观众即可看到这些巨型的石阶、人像的巨石，在这个充满史前遗迹的玄幻空间里，徐克导演将会带来一场曲折悬疑的爱情故事。